幕府的财务窘境直接影响了军人阶层的糊口，因为俸禄不能定时发放，即便发放也被幕府和大名们以各种启事剥削，一些中低层军人沦为停业的游勇，或是凭借于贩子。德川幕府初期制定的身份品级轨制开端悄悄崩溃。
1600年9月，德川家康与石田三成两派之间发作了闻名的“关原合战”。这一战德川家康获得终究胜利，代替丰臣氏把握了天下政权。1603年，时人称之为“老狐狸”的德川家康被封为“征夷大将军”，受封后不久，立即在江户城开设幕府，开端了最强大也是最后的武家政权。这一期间被先人称为“江户期间”。
“大老”是德川幕府临时设置的最高官职，卖力政务，参与首要政策的肯定；“老中”是幕府中心常设的最高职务，直属征夷大将军统辖，是具有最大权力的政务官；“若年寄”首要卖力办理将军直属的武将“旗本”以及家臣“御家人”；“奏者番”是礼节官，卖力幕府所用礼节事项；“高家”是“老中”的属官，掌管幕府的典章；“大目付”也是“老中”的属官，首要卖力对各地大名的监察；“町推行”卖力掌管江户城内的民政与刑事事件；与其同为一级的“勘定推行”卖力幕府的财务；寺社推行主管天下的寺院和神社。
锁国期间的日本，农业出产程度大幅进步。因为幕府大力鼓励农夫开开荒地，日本的耕空中积有了大幅度的进步，从17世纪初德川幕府方才建立时的170多万公顷，增加到了18世纪中期的300万公顷。地盘的增加和农业的生长也动员了先进耕具的呈现，使得农夫的糊口较之以往有了很大的改良。
也就在这一期间，幕府抓紧了对外贸易的限定，1623年和1624年，幕府前后制止了与英国和西班牙的贸易，1635年，幕府公布禁船令，严禁各种船只驶往外洋，违令者处斩，家小没入官府，卖为奴婢。固然幕府还是答应中国和荷兰的商船来日本互市，但停靠地和贸易地只限于长崎一港，其行动范围也被严格限定。除此以外，到长崎的中国人与荷兰人都要向幕府提交有关先容内部天下的环境陈述书，被称为“风平话”。由中国人提交的环境陈述书叫做“唐风平话”，由荷兰人提交的则称为“荷兰风平话”。德川幕府依托这类体例来体味内部环境。由此，德川幕府统治下的日本进入了自我封闭状况，汗青大将这一期间称为“锁国期间”。
农夫的失地和军人的停业直接影响了幕府的统治，为了化解这一危急，德川幕府别离在第四代将军德川吉宗、第十一代将军德川家齐、第十二代将军德川家庆在位期间实施了鼎新，即“享保鼎新”、“宽正鼎新”、“天保个鼎新”三大鼎新。
或许是为了向曾经奉养过的“太阁”丰臣秀吉学习，或许是为了安定德川氏永久的统治，1605年，德川家康把“征夷大将军”的职位让与儿子德川秀忠，自称“大御所”并隐居骏府城，但在背后仍然把握着幕府军政实权。1615年5月，德川家康策动“大阪之役”，完整打倒了一向与本身作对的丰臣秀赖及其跟随权势，1616年3月，他出任太政大臣，并向明朝天子称藩，被明朝天子册封为“日本国王”。
俗话说偶然插柳柳成荫，本来为了加强对大名的羁系，制定了参觐轨制，但是跟着大名每年按期来到江户，且随行有大量的家臣和侍从，这些人悠长住在江户，极大地促进了江户地区贸易、文娱业的生长，也直接动员了文艺的鼓起，并终究生长成为独具日本特性的艺术情势。当代日本的传统文明，诸如茶道、花道、相扑、艺伎等都是在这一期间鼓起并成形的。